Unidad de Proteómica
Misión
La Unidad de Proteómica tiene como objetivo principal fomentar la investigación científica y el desarrollo tecnológico en el área de la proteómica, ofreciendo a los grupos de investigación, hospitales y empresas diferentes servicios de proteómica, asesoramiento en sus proyectos, así como seminarios y cursos de formación.
Descripción
En la Unidad de Proteómica no solo se realiza identificación de proteínas aisladas. Las técnicas ofertadas permiten la identificación de las proteínas que componen el proteoma de forma masiva. Se pueden hacer estudios de proteómica cuantitativa que permiten comparar la abundancia relativa de las proteínas en diferentes muestras. Además se pueden realizar estudios de interacciones proteína con otras proteínas, y estudios de modificaciones postraduccionales como fosforilaciones. Además, se ofertan servicios de Proteómica dirigida, que permiten buscar y validar biomarcadores en muestras biológicasy clínicas complejas.
Servicios ofertados por la Unidad de Proteómica
Espectrometría de Masas |
Determinación de masas moleculares de proteínas. Identificación de proteínas mediante huella peptídica. (MS) Identificación de proteínas mediante fragmentación de péptidos. (MS/MS) Secuenciación de péptidos. |
---|---|
Espectrometría de masas acoplada a cromatografía líquida |
Análisis de mezclas de proteínas de alta complejidad. Análisis de subproteomas. Estudio de proteínas de superficie celular (surfoma) |
Separación de proteínas |
Electroforesis monodimensional, SDS-PAGE. E electroforesis bidimensional (2D-PAGE) Isoelectroenfoque en fase líquida preparativo. Separación de complejos proteicos (Blue-Native) Análisis de inmunoproteomas. |
Separación de péptidos |
Cromatografía de fase reversa Cromatografía de intercambio iónico Isoelectroenfoque en fase líquida preparativo. |
Estudio de expresión diferencial |
Proteómica cuantitativa en gel: marcaje con fluorocromos DIGE. Proteómica cuantitativa sin gel: marcaje isotópico iTRAQ, marcaje metabólico SILAC Proteómica cuantitativa libre de marcaje (label free) |
Estudio de modificaciones postraduccionales |
Fosfoproteómica. Otras modificaciones: acetilación, ubiquitinación… |
Estudios de Proteómica dirigida |
Análisis por MRM. |
Otros |
Transferencia a membranas de PVDF.Espectrometría de masas |
Instalación
La Unidad de Proteomica es una unidad del Centro de Asistencia a la Investigación (CAI) de Genómica y Proteómica de la Universidad Complutense de Madrid, ubicada en la Facultad de Farmacia de la Universidad Complutense de Madrid (UCM). Pertenece a la red de Laboratorios de la Comunidad de Madrid (LAB.185).
Tecnología
- Espectrómetro de masas Q-exactive HF (Thermo Finnigan).
- Espectrómetro de masas QTRAP 5500 (AB SCIEX).
- Espectrómetro de masas 4800 Proteomics Analyzer con TOF/TOF (AB SCIEX). Espectrómetro de masas tipo Trampa iónica lineal segmentada LTQ (Thermo Finnigan).
- Sistema de nano-cromatografía líquida capilar ETTAN LC (GE).
- Escáner de fluorescencia Typhoon 9400 (GE).
- Sistema EttanTM para Electroforesis Bidimensionales (GE). Fraccionador por Isoelectroenfoque en líquido, OFFGEL (Agilent).
Personas
Dra. Concha Gil García
Catedrática de Microbiología de la Universidad Complutense de Madrid. Investigadora del Departamento de Microbiología y responsable científico de la Unidad de Proteómica UCM-Parque Científico de Madrid. Vice-presidenta de la Sociedad de Proteómica Española.
Personal Técnico:
María Luisa Hernáez Sánchez, Lda. en Farmacia por la Universidad Complutense de Madrid, Máster en Biotecnología por la Universidad Complutense de Madrid y responsable técnico de la Unidad de Proteómica.
Lola Gutiérrez Blázquez, Lda. en CC Biológicas por la Universidad Complutense de Madrid, Máster en Biotecnología por la Universidad Complutense de Madrid
Felipe Clemente Velarde, Doctor en Bioquímica por la Universidad Autónoma de Madrid. Inés Zapico , Licenciada en Ciencias Químicas por la Universidad de Oviedo.
Enrique Pérez, Máster de Bioinformática por la Universidad de Murcia.
Guía de documentación de la Unidad
La unidad posee todos los procedimientos, instrucciones técnicas y registros de acuerdo a la norma ISO UNE-EN ISO 9001:2008 obtenida en el 2010.
Personas de contacto
Dra. Concha Gil García
Responsable científico
E-mail: conchagil(ELIMINAR)@ucm.es
María Luisa Hernáez Sánchez
Responsable técnico
E-mail: mlhernae(ELIMINAR)@ucm.es
Unidad de proteómica Pza. Ramón y Cajal, s/n
Facultad de Farmacia - UCM 28040 - Madrid
Tel: (+34) 91 394 16 13
Fax: (+34) 91 394 17 45
cai.proteomica(ELIMINAR)@pas.ucm.es