Unidad de Proteómica

Misión

La Unidad de Proteómica tiene como objetivo principal fomentar la investigación científica y el desarrollo tecnológico en el área de la proteómica, ofreciendo a los grupos de investigación, hospitales y empresas diferentes servicios de proteómica, asesoramiento en sus proyectos, así como seminarios y cursos de formación.

Descripción

En la Unidad de Proteómica no solo se realiza identificación de proteínas aisladas. Las técnicas ofertadas permiten la identificación de las proteínas que componen el proteoma de forma masiva. Se pueden hacer  estudios de proteómica cuantitativa que permiten comparar la abundancia relativa de las proteínas en diferentes  muestras. Además se pueden realizar estudios de interacciones proteína con otras proteínas, y estudios de modificaciones postraduccionales como fosforilaciones. Además, se ofertan servicios de Proteómica dirigida, que permiten buscar y validar biomarcadores en muestras biológicasy clínicas complejas.

Servicios ofertados por la Unidad de Proteómica

Espectrometría de Masas

Determinación de masas moleculares de proteínas. Identificación de proteínas mediante huella peptídica. (MS)

Identificación de proteínas mediante fragmentación de péptidos. (MS/MS) Secuenciación de péptidos.

Espectrometría de masas acoplada a cromatografía líquida

Análisis de mezclas de proteínas de alta complejidad. Análisis de subproteomas.

Estudio de proteínas de superficie celular (surfoma)

Separación de proteínas

Electroforesis monodimensional, SDS-PAGE. E electroforesis bidimensional (2D-PAGE)

Isoelectroenfoque en fase líquida preparativo. Separación de complejos proteicos (Blue-Native)

Análisis de inmunoproteomas.

Separación de péptidos

Cromatografía de fase reversa Cromatografía de intercambio iónico

Isoelectroenfoque en fase líquida preparativo.

Estudio de expresión diferencial

Proteómica cuantitativa en gel: marcaje con fluorocromos DIGE.

Proteómica cuantitativa sin gel: marcaje isotópico iTRAQ, marcaje metabólico SILAC

Proteómica cuantitativa libre de marcaje (label free)

Estudio de modificaciones postraduccionales

Fosfoproteómica.

Otras modificaciones: acetilación, ubiquitinación…

Estudios de Proteómica dirigida

Análisis por MRM.

Otros

Transferencia a membranas de PVDF.Espectrometría de masas

Instalación

La Unidad de Proteomica es una unidad del Centro de Asistencia a la Investigación (CAI) de Genómica y Proteómica de la Universidad Complutense de Madrid, ubicada en la Facultad de Farmacia de la Universidad Complutense de Madrid (UCM). Pertenece a la red de Laboratorios de la Comunidad de Madrid (LAB.185).

Tecnología

  • Espectrómetro de masas Q-exactive HF (Thermo Finnigan).
  • Espectrómetro de masas QTRAP 5500 (AB SCIEX).
  • Espectrómetro de masas 4800 Proteomics Analyzer con TOF/TOF (AB SCIEX). Espectrómetro de masas tipo Trampa iónica lineal segmentada LTQ (Thermo Finnigan).
  • Sistema de nano-cromatografía líquida capilar ETTAN LC (GE).
  • Escáner de fluorescencia Typhoon 9400 (GE).
  • Sistema EttanTM para Electroforesis Bidimensionales (GE). Fraccionador por Isoelectroenfoque en líquido, OFFGEL (Agilent).

Personas

Dra. Concha Gil García

Catedrática de Microbiología de la Universidad Complutense de Madrid. Investigadora del Departamento de Microbiología y responsable científico de la Unidad de Proteómica UCM-Parque Científico de Madrid. Vice-presidenta de la Sociedad de Proteómica Española.

Personal Técnico:

María Luisa Hernáez Sánchez, Lda. en Farmacia por la Universidad Complutense de Madrid, Máster en Biotecnología por la Universidad Complutense de Madrid y responsable técnico de la Unidad de Proteómica.

Lola Gutiérrez Blázquez, Lda. en CC Biológicas por la Universidad Complutense de Madrid, Máster en Biotecnología por la Universidad Complutense de Madrid

Felipe Clemente Velarde, Doctor en Bioquímica por la Universidad Autónoma de Madrid. Inés Zapico , Licenciada en Ciencias Químicas por la Universidad de Oviedo.

Enrique Pérez, Máster de Bioinformática por la Universidad de Murcia.

Guía de documentación de la Unidad

La unidad posee todos los procedimientos, instrucciones técnicas y registros de acuerdo a la norma ISO UNE-EN ISO 9001:2008 obtenida en el 2010.

Personas de contacto

Dra. Concha Gil García
Responsable científico
E-mail: conchagil(ELIMINAR)@ucm.es

María Luisa Hernáez Sánchez
Responsable técnico
E-mail: mlhernae(ELIMINAR)@ucm.es

Unidad de proteómica Pza. Ramón y Cajal, s/n
Facultad de Farmacia - UCM 28040 - Madrid
Tel: (+34) 91 394 16 13
Fax: (+34) 91 394 17 45
cai.proteomica(ELIMINAR)@pas.ucm.es